儿童孤独症的病因有很多因素。 《自闭症孩子》
在后来对家庭因素的调查研究中，国内外学者主要讨论的是父母自身的身心特点。父母的认知水平、精神心理特征可能与孩子的自闭症有关。此外，母亲孕期的营养状况、疾病史、用药史、重大精神创伤等问题，都可能导致孩子出现自闭症。
出生后，自闭症儿童大脑的重量会在几年内迅速增加，然后自闭症儿童大脑的生长速度会变慢，但此时同龄儿童的大脑会继续生长。自闭症儿童的大脑在儿童期快速生长后，生长速度会逐渐降低，出现异常缓慢的生长趋势，甚至部分自闭症儿童会出现停滞。
对双胞胎和自闭症患者家属的研究表明，部分患者具有明显的遗传易感性。同卵双胞胎中一个有自闭症，另一个有60%甚至90%的几率患病；但是，异卵双胞胎只有5%的患病几率。结合自闭症的发病率，有研究推测自闭症及类似行为特征的遗传率高达90%。此外，直系亲属的患病率也受遗传因素的影响，自闭症儿童的兄弟姐妹的风险会明显增加。研究人员还发现，自闭症儿童的家庭成员有更多的社交能力或重复性行为异常，以及一些情绪障碍，如双相情感障碍。还有一种理论认为，重复、刻板、注重秩序和规则等明显超系统行为的两个人，婚后更容易生出自闭症孩子。
目前医学界普遍认为自闭症是由生物因素引起的，但到底是哪种生物因素尚无定论。这也说明了导致儿童自闭症的可能因素有很多，包括疾病的来源和途径。从以往的研究中可以看出，自闭症儿童的病因中有很多因素可能相互作用:
一般来说，自闭症儿童患的不是一个脑结构的病变，而是几个脑区的病变，甚至是脑区之间的异常联系。但是，大脑哪个区域有问题，并没有一致的结论。
脑生物学的研究主要集中在这几个方面:脑基因、脑细菌感染、妊娠分娩感染(存在于羊水中)、不明原因的细微脑损伤等。
自闭症儿童不能进行眼神交流，不能识别面部表情，面部记忆有问题。据说自闭症儿童杏仁核有缺陷。
Kanner等早期研究者提出，自闭症儿童的父母是“冰箱型父母”，导致儿童在情感上离开父母，回归内心世界。这个观点得到很多人的认同，精神动力治疗师和行为主义者都支持这个观点，这给自闭症儿童的父母造成了很大的精神压力，让他们感到内疚和内疚。
就自闭症儿童的脑叶发育而言，存在明显的异常发育状态，且大于同龄儿童。
负责主要个体的语言习得功能。因为自闭症儿童有语言障碍，所以在bull kar区自闭症儿童被认为是有问题的，主要表现在bull kar区自闭症儿童对角线带的细胞核数低于同龄儿童，成人的细胞核数也明显较少。
自闭症儿童的脑干明显小于同龄儿童，中脑、脑桥、延髓均有不同程度的异常。
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