微生物在自闭症特征中发挥重要作用的研究报告引发了冲突。 [孤独症]
Lumley开始用题目中描述的方法重新分析。这种方法解释了所有粪便移植供体之间的随机差异，然后寻找与自闭症供体相关的差异。“我认为这是正确的分析，但它没有给出他们给出的结果，也没有提供多少差异的证据，”Lumley说。
为了上述分析，研究人员将捐赠者、5名自闭症男孩和3名对照儿童的粪便移植到至少8只不同的小鼠体内。他们发现，作为一个群体，有自闭症男孩粪便的老鼠比对照组埋更多的弹珠，它们与其他老鼠互动的时间更少，在开放的房间里行走的距离更短。这些结果出现在Mitchell等人提供的三个图表中。
但在他们的统计分析中，研究人员似乎独立地对待了每组小鼠，即使一些小鼠的粪便来自同一个捐赠者，Lumley说。这个错误人为夸大了每组的样本量。根据他的重新分析，在纠正这个错误后，唯一有统计学意义的差异是老鼠埋葬的弹珠数量。
其他人担心这项研究的样本量太小。
“P值只是总结了实验中的数据，”米切尔说。“如果这是一个非同寻常的断言，如果它需要一些新的生物学机制，而这些机制实际上是未知的，也没有研究基金会强烈支持它，那么我们应该要求更高标准的证据。”
研究人员坚持他们最初的结果:“当我们今天坐在这里时，我们没有在我们所做的统计中发现任何错误。”但是帕萨迪纳加州理工学院的微生物学教授Mazmanian说，他已经要求一些统计学家重新分析这些数据。他说，“我们想把这件事做好。”“我们将尽一切可能确保得出一个我们可以捍卫的结论。”
类似的评论促使没有参与这项研究的统计学家托马斯·拉姆·拉姆利重新分析了这些数据。6月16日，拉姆利在个人博客上发表了他的重新分析。他的结论是，这项研究的一个关键发现是，老鼠的社交活动比对照组少，这可能是由有缺陷的统计分析造成的。
问题可能出在研究人员使用的SPSS软件上。Mazmanian说，该小组的统计人员遵循软件的指导方针。即使统计分析没有被证明是有缺陷的，批评者说，令人兴奋的发现需要达到比p值更高的标准。
在一项备受瞩目的研究中，许多科学家指出了分析和解释中可能存在的错误。这项研究表明，微生物可以缓解小鼠的自闭症样行为。《纽约时报》发表几个小时后，推特和出版后评论网站PubPeer上出现了激烈的反应。
该论文的批评者还指出，该团队的四名成员已经申请或批准了使用微生物或微生物分子治疗自闭症和其他疾病的专利。Mazmanian也是Axis Bitherapeueutics的联合创始人和董事，该公司开发了针对这些疾病的肠道疗法。
研究发表几分钟后，独立专家开始在推特上对论文中的三个图表表示担忧。
“你在论文中看到的数据具有误导性，因为它看起来有许多数据点，但实际上它们来自一小部分参与者，”前自闭症研究人员乔恩·布洛克说。布洛克在6月13日出版的Medium上发表了一篇文章，批评了研究人员使用的小样本量和行为测试。他写道:“鉴于这项研究的规模，其核心论点的证据非常薄弱。”
米切尔说，更高的标准是复制。另一种是注册报告，这是一种同行评审的期刊文章，研究人员在收集数据之前首先描述他们的研究方法。
他们提出的每张图表对应的“P值”(统计显著性的衡量标准)似乎都不靠谱。“这些数据没有通过我所谓的眼球测试，”推特用户之一、爱尔兰都柏林三一学院遗传学副教授凯文·米切尔说。
“作者的分析不适合他们的实验设计，而且没有明确描述，因为论文中两个不同的地方有相互矛盾的描述，”新西兰奥克兰大学生物统计系主任Lumley说。
然后，他根据他在方法部分找到的描述和研究人员在PubPeer上提供的其他细节，重新分析了这些数据。他可以重现这三张图的p值。然而，他说，奇怪的是，研究人员对待每只老鼠就好像它接受了不同捐赠者的粪便一样。“这是一个奇怪的分析，”Lumley说。“我不明白你为什么要故意这样做。”
不要让我从大多数分析中使用的5个案例中的3个对照和N个案例开始。捐赠者之间的差异是巨大的。——乔纳森·斯巴特(@ sebatlab)2019年5月30日。
一些批评者说，现在说微生物化合物可以缓解自闭症还为时过早。
Lumley表示，他对重新分析感到困惑，因为尽管Sarkis Mazmanian的团队已经在网上提供了数据，但他们在图片描述中描述的统计方法与论文的方法部分不一致。“图片说明中的那个很清楚，但不是他们做的，”Lumley说。“部分方法不是很清楚。”
考虑到要检测的变量很多，发现一些差异也就不足为奇了。没有对重复样本进行检验，所以我之前的预期是，除非被证明是真的，否则这些样本都是假的。——凯文·米切尔(Kevin Mitchell @ wireting the Brain)2019年5月30日。
在5月30日发表在《细胞》杂志上的一篇论文中，Sarkis Mazmanian和他的同事报告说，自闭症男孩的粪便移植可以引发小鼠的自闭症样行为，而某些微生物的分子可以缓解这些行为。
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