“多基因变异风险值(PRG)”能否提高对自闭症和精神分裂症的预测？ {自闭症的表现}
该方法基于这样的概念，即根据个体染色体中常见基因变异的数量，可以将22q缺失的个体是否患有精神发育迟滞或精神分裂症与这两种疾病相关联。具有最高PRG的个体最有可能患有这些诊断中的一种，而具有最低分数的个体最不可能。这是沃尔斯特曼和他的同事研究的方法。
现在，如果我们想把这个模型推广到普通人群——假设精神分裂症的基线几率在普通人群中是1%——那么PRG会作用在一个非常低的基线上，对临床应用的意义不大。
例如，一个基因突变大大增加了该人群患自闭症的可能性——这种基因突变的数量越来越多——因此可以想象使用PRG可以提高预测自闭症的可能性。当然，要弄清楚这一点还需要更多的研究。目前可以确定约10%至20%自闭症个体的遗传机制，这些人是检验这种PRG的最佳人选。
然而，如果你是一个长期重度吸烟者，假设你患肺癌的几率是15%。那么，当你去那个城市生活时，你患肺癌的几率从15%增加到30%。临床上很重要。
这些百分比反映了这种基因变异在人群中的统计作用，但很难说它将如何影响每个人。这种模糊的关系导致了一些重要的问题:例如，如果一个孩子缺少染色体22q11.2，他或她应该像自闭症儿童一样在诊断前进行早期干预吗？这个孩子未来可能还有哪些障碍？
假设一个孩子出生时有22q缺失，我们可以根据染色体的其他遗传变异进行预测。这个孩子实际上很可能患有自闭症——比如说，概率高于80%。如果这个预测足够准确，那么我们就有足够的理由为孩子提供早期干预。
Vorstman接受了Spectrum的采访，讨论这种方法如何更准确地预测遗传风险，同时讨论将PRG概念应用于自闭症遗传预测的可能性。
例如，22q缺失和高精神分裂症PRG的个体更可能患有精神分裂症。不是25%，而是33%。
同时，一些个体的PRG较低，因此他们患精神分裂症的几率从25%下降到9%。
本文的翻译并不代表潇雅自闭症项目完全赞同其观点，而是本着尊重原创的原则，力求忠实准确地翻译。——2022年美国圣路易斯的美国亚亚爸爸。
作者:AngieVoylesAskham；安吉是一个致力于自闭症研究的新闻报道。她拥有纽约大学神经科学博士学位和范德比尔特大学学士学位。
序
遗传学研究的结果表明，一些突变可能导致多种表型:例如，染色体区域22q11.2缺失的人约有21%患有自闭症，41%患有精神发育迟滞，23%患有精神分裂症。
如果没有PRG信息，那么，有这种缺陷的个体只能根据现有的数据进行预测，未来诊断为自闭症的平均概率约为30%。这么低的概率，很难决定是否应该进行早期干预。也就是说，如果你对10个孩子进行早期干预，其中7个最终不会被诊断为自闭症的孩子也会被干预。鉴于早期干预的高强度和相关成本，做出这一决定非常重要。
尽管如此，我们仍然希望用催乳素来研究自闭症。但是，由于我们的样本来自不同的地方，自闭症的表型描述也不一致，所以我们没有足够的样本来研究。目前离目标还很远。
使用PRG预测22q缺失个体患精神分裂症或精神发育迟滞的可能性是有效的，因为这两种疾病都有足够的基线概率数据:任何22q缺失的个体都有25%的机会患精神分裂症。有了这个高基线数据，再考虑他们的PRG，这个预测有一定的临床价值。
我觉得这是一个很重要的问题，因为自闭症和智障往往是常见的障碍。当然，它不是一成不变的。我们知道有些人非常聪明，但他们仍然有严重的自闭症。我们也知道有些人有重度或中度的精神发育迟滞，但社交能力相当好，不符合自闭症的标准。所以，虽然自闭症和智障会是常见的障碍，但并不确定——这个问题本身就很有意思。
我的个人兴趣包括智商和认知能力。智商和认知能力可以和自闭症分开衡量，所以可以衡量这两种表型的严重程度。这样就可以评估这些表型(自闭症和认知技能和智商)与智商的PRG和自闭症的PRG之间的相关性。
智障也是如此。在我们的样本中，精神发育迟滞的基线概率为42%。但是，当考虑智商的PRG时，我们实际上可以找出一个亚组，其智力迟钝的概率为63%，远高于基线，而另一个亚组的概率更低，为24%。
换个说法:如果你住在某个城市，不管什么原因，都会让你患肺癌的几率增加一倍。假设不吸烟，患肺癌的几率是0.1%。然后在这个城市生活，肺癌风险翻倍，从0.1%增加到0.2%。从临床的角度来看，这么小的基线概率意义不大。
一个明显的实际差异是，PRG还没有很好地应用于自闭症研究。虽然自闭症的PRG是在精神病学基因组学联合会中计算的，但目前的版本是基于小样本，比精神分裂症的小得多。因此，与精神分裂症不同，自闭症的“多基因变异贡献值”并不能解释自闭症的基因贡献。
Vorstman和他的同事建立了一种方法，可以预测染色体22q11.2缺失的个体患精神发育迟滞或精神分裂症的可能性。这项工作发表在2021年11月的《自然医学》杂志上。方法利用个体DNA中所有与精神发育迟滞或精神分裂症相关的常见遗传变异来计算“多基因风险因子”(PGS)。
这些数字的准确性还有待提高，不能应用于临床。但这表明了某种可能性。
那么，我们能把自闭症的PRG应用到普通人群中吗？当然，但这没有临床意义。但是，如果一个亚组可以被单独隔离，无论什么原因，他们患自闭症的几率都会增加，那么这可能是有临床意义的。
之前的研究表明，染色体22q11.2缺失的人更容易患精神分裂症和智力低下。我们的研究发现，这种可能性的可能性部分取决于染色体其他部分的变异。
加拿大多伦多大学精神病学副教授JacobVorstman在接收了大量22q11.2缺失的个体后，一直在思考这些问题。他希望更准确地预测他们的生长发育和未来的生活质量。
指导阅读
基因突变被认为是自闭症的重要机制，那么基因测序能准确预测儿童自闭症吗？近年来，自闭症的生物学研究发现了数百甚至数千个可能与自闭症有关的基因。然而，尽管一些基因变异被认为会导致一些特定的自闭症亚型，但事实是自闭症的特定亚型会有特定的基因变异，这反过来又是不正确的。所以，即使基因测序后发现了特定的突变，也很难预测孩子会不会得自闭症。
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