自闭症患者治疗前后肠道菌群的分布多样性 {自闭症}
稀释曲线[11]是从样本测序后获得的所有序列中提取一些序列(读数)。提取的序列数量是随机的，然后统计每个提取的序列包含多少otu(即多少物种)。最后以提取的序列数为横坐标，对应的OUT数为纵坐标，画出曲线。C组、R组和Z组的对比稀释曲线都趋于平缓，最后曲线几乎重合，说明本次测序获得的otu数量差异不大，本次测序的数据量是合理的。
制备三个样品，两个用于基因组DNA提取和随后的测序，剩下的一个留作后用。所有过程应在粪便收集后15分钟内处理完毕，然后保存在-80℃冰箱中备用。
标准粪便的收集:收集筛选和知情的受试者的新鲜粪便，立即放入冰盒中，运送到实验室进行预处理。包装处理:按分组顺序对样品进行编号，准确称取每份样品200mg，置于新的无菌2ml离心管中，每次
Shannon-Wiener[11]是用于评价样品中微生物群落多样性的指标。以每个样品的不同测序深度为横坐标，以每个测序深度对应的样品多样性指数为纵坐标，构建一条曲线，从而反映每个样品在不同测序深度的微生物种类多样性。最后，当曲线趋于平缓时，说明这次测序的数据足够大，不需要额外的数据就能反映出每个样品中大多数微生物的存在。C组、R组和Z组，Shannon指数曲线趋于平缓，最终接近重合，说明测序数据合理，能够反映样品中大部分微生物的信息。
自闭症谱系障碍(ASD)是一种发育性神经行为障碍，以行为受限、重复、社会交往和交流障碍为特征[1，2]。其中，自闭症是ASD的主要类型[3，4]。自闭症已经成为儿童精神残疾的重要疾病。随着发病率的增加，自闭症给患者家庭造成了极大的精神压力和经济负担，同时也给社会造成了不良影响。导致自闭症的因素很多，包括环境因素、家庭因素、代谢因素、遗传因素、免疫系统异常[5]、脑器质性损伤等。，以及各种因素之间的相互作用。但到目前为止，自闭症的发病机制尚未完全阐明。2表入组研究对象表患者组健康对照组总研究对象男/女年龄(年)治疗持续时间2018/23.49 1.262 . 572018/24.56 1.15近年来，有学者提出了“脑-肠-微生物轴”这一术语[6]，他们认为:在肠道内。因此，肠道有时被称为人的“第二大脑”或“肠脑”[7]，肠道可以通过多种方式影响中枢神经系统，从而影响人的情绪、认知和行为[8]。肠道菌群参与免疫系统的成熟，也可以通过迷走神经和神经递质导致神经精神障碍。过去人们对肠道微生物的研究方法主要依靠分离培养技术，但肠道内可培养的细菌很少，仅占肠道细菌总数的一小部分，而且肠道内的大部分微生物很难人工培养。近年来，随着分子生物学技术的发展，一种快速、灵敏的病原微生物检测方法——16S r RNA基因序列分析技术诞生了，不仅解决了漫长而复杂的研究过程、细菌培养的困难，还解决了易受药物干扰等诸多问题[9，10]。本研究收集了自闭症患者治疗前(R组)、治疗后(C组)和健康对照儿童(Z组)的20份粪便样本，通过16s r RNA测序技术和生物信息学分析比较各组肠道菌群分布的差异。
学中研究微生物多样性， 通过单样本的多样性分析（Alpha 多样性）可以反映微生物群落的丰度和多样性， 包括一系列统计学分析指数估计环境群落 的 物 种 丰 度 和 多 样 性 。 计 算 菌 群 丰 度（Community richness） 的指数有： Chao 和 Ace ；计算菌群多样性 （Community diversity） 的指数有：Shannon 和 Simpson；测序深度指数有：Coverage。 两两比较结果如下。菌群多样性指数(Shannon 和 Simpson)分析中，ZC 和 ZR 比较均 P
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